Вероятно проблема в том, что в настоящее время поисковые системы используют такую технологию как «Персонализация выдачи». Поисковые машины знают историю поиска и подправляют результаты своей выдачи с учетом того, что Вы искали раньше. Поэтому даже на разных браузерах Вашего компьютера результаты поиска могут быть разными. К понятию «позиция сайта» сейчас стоит относиться с учетом на то, что сайт может быть выше или ниже на несколько позиций и это нормально для персонализированной выдачи. Персонализацию выдачи можно отключить в настройках поисковой системы:

Яндекс. Убрать персонализацию выдачи можно через настройки.
 
Для того, чтобы убрать персонализацию выдачи в Google необходимо удалить файлы cookie из браузера, либо открыть браузер в режиме «инкогнито».
 
Еще одной причиной, по которой позиции Вашего сайта могут отличаться – это регион продвижения. Убедитесь, что при продвижении сайта вы указали правильный регион и он соответствует тому региону в котором вы проверяете позиции:

Регион продвижения должен соответствовать региону в настройках поиск.

Если вы убрали в настройках персонализированную выдачу, проверили регион, а позиции все равно отличаются, то напишите нам в техподдержку через форму ниже и мы обязательно разберемся в проблеме.