Общие и брендовые запросы подбираются из нескольких источников. Анализируются запросы, по которым ваш сайт уже находится в топ-50 поисковиков, анализируется статистика поисковых систем, контент на сайте и, конечно, файл YML.
Те категории товаров, которые вы заблокировали в настройках при создании проекта, не попадут и в общие и в брендовые запросы.